1955年生於台北市，先後就讀東門國小、仁愛國中、建國中學、台灣大學商學系、1985年獲美國密西根大學經濟學博士，旋即返國，在中央研究院與台灣大學從事教學研究。2016年10月，政府借調朱教授擔任我國駐世界貿易組織（WTO）常任代表。
朱教授於1998年獲選中央研究院院士，當時為近20年選出之最年輕院士。2003年渠獲頒總統科學獎，當時也是國內第一位獲獎者。朱教授於2010年獲選第三世界科學院（TWAS）院士。2017年復獲選美國國家科學院（NAS）海外院士，是亞洲第一位獲選的社會科學研究者。
朱教授於1999年開辦國科會高中生人文社會科學營以及人文社會養成班，並親自赴北、中、南、東四地高中，分別開授一學期十五週之「社會科學概論」，播種耕耘，作育下一代的人文社會研究人才。